Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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