Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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TCOF1Q13428 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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TCOF1Q13428 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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TCOF1Q13428 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TCOF1Q13428 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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