Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC00663-206ENST00000589910 732 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 TTC41P-204ENST00000548897 2998 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC01091-204ENST00000515769 2204 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 PCDH15-226ENST00000613657 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MAGEB18-201ENST00000325250 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 TIMM21-204ENST00000580087 2524 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 KLHL32-202ENST00000369261 3698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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