Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TDP1Q9NUW8 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms