Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CIPCQ9C0C6 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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