Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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FXNQ16595 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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FXNQ16595 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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FXNQ16595 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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FXNQ16595 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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FXNQ16595 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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FXNQ16595 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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FXNQ16595 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
FXNQ16595 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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