Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 FRMPD4-202ENST00000616992 7916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 ERN1-201ENST00000433197 7876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 ATAD2B-201ENST00000238789 8103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 ATF7-202ENST00000456903 5218 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RYR3Q15413 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms