Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RUNX3Q13761 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153 ms