Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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