Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PPIAP14-201ENST00000577627 496 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms