Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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PTPRCP08575 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PTPRCP08575 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PTPRCP08575 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PTPRCP08575 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PTPRCP08575 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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PTPRCP08575 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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PTPRCP08575 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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PTPRCP08575 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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PTPRCP08575 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRCP08575 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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