Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC9Q96Q05 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms