Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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