Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SL731P-201ENST00000584329 293 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL10P15-201ENST00000585756 315 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC007998.3-202ENST00000591141 697 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC003098.1-201ENST00000591540 494 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AP003481.1-202ENST00000608214 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC004853.2-201ENST00000609561 916 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.148-201ENST00000614489 291 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC215522.1-201ENST00000615488 446 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC02391-201ENST00000615716 800 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SLC20A1P2-201ENST00000618036 966 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZNF195-229ENST00000618467 440 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 FBXO47-201ENST00000378079 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ELAVL2-203ENST00000380117 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 HELLS-206ENST00000394045 2699 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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ANKRD39Q53RE8 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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ANKRD39Q53RE8 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL136087.1-201ENST00000305491 426 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SMIM23-201ENST00000330910 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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ANKRD39Q53RE8 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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ANKRD39Q53RE8 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LYSMD1-202ENST00000440902 1003 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AP002856.4-201ENST00000441638 569 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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ANKRD39Q53RE8 AL606804.1-202ENST00000446347 481 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL683842.1-201ENST00000455505 525 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SL464P-201ENST00000492743 297 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNA5-8SP6-201ENST00000515896 152 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
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