Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRRQ15256 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms