Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NFIXQ14938 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms