Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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