Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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CUL3Q13618 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CUL3Q13618 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CUL3Q13618 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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CUL3Q13618 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CUL3Q13618 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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