Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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FOXE3Q13461 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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FOXE3Q13461 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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FOXE3Q13461 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
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