Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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SGCGQ13326 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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SGCGQ13326 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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SGCGQ13326 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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SGCGQ13326 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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