Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ELP2-203ENST00000358232 8459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 SNORD83A-201ENST00000386747 95 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 SNORD88A-201ENST00000408314 91 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 GAPDHP45-201ENST00000452090 349 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 HNRNPCP7-201ENST00000456056 905 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ADAMTS9-AS2-204ENST00000485174 573 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ANAPC15-211ENST00000542531 812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 HIGD1B-205ENST00000591513 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC122710.3-201ENST00000606566 541 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 FAM238B-204ENST00000612040 423 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC106872.12-201ENST00000622170 547 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC005086.2-201ENST00000624939 228 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AL356481.2-201ENST00000629902 528 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 CLEC4M-204ENST00000359059 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AL451074.2-201ENST00000423121 2150 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 CYB5D1-201ENST00000332439 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC010320.4-201ENST00000594379 1905 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RUBCNL-202ENST00000378784 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ZNF215-202ENST00000414517 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 DOCK8-209ENST00000469391 6386 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ZMYND11-216ENST00000602682 1687 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 BCL6-202ENST00000406870 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 MAATS1-201ENST00000273390 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 SCAF11-205ENST00000465950 5296 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC009060.1-202ENST00000502126 2242 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ZBTB40-204ENST00000404138 8992 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 LAMB4-203ENST00000418464 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RAD51B-212ENST00000488612 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 TEX11-203ENST00000374333 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 POLR1B-203ENST00000409894 4457 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 R3HDM2P1-201ENST00000505381 1960 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 LAMA3-207ENST00000587184 5007 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 CCT5-213ENST00000515390 1728 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC128688.2-201ENST00000563632 1937 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 MTHFD1-201ENST00000216605 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 BTBD3-202ENST00000378226 4904 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 PAICS-207ENST00000512576 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 PCBP1-AS1-243ENST00000458698 1893 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RN7SKP93-201ENST00000363838 309 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AL023773.2-201ENST00000412173 1005 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 MAGEB6P1-201ENST00000416929 1224 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 OSBPL10-AS1-201ENST00000417313 475 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC127537.1-201ENST00000418183 748 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 LINC01687-202ENST00000419467 465 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AL355863.1-201ENST00000424331 293 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC069213.3-201ENST00000454858 474 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RN7SKP241-201ENST00000464584 291 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RN7SL302P-201ENST00000475999 300 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC112173.1-201ENST00000505876 327 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 SRD5A3-AS1-202ENST00000510637 926 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 BRWD1P2-201ENST00000546823 340 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AL133371.3-201ENST00000556197 549 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AP007216.1-201ENST00000563932 385 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AL022345.3-201ENST00000611406 228 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 PKP4-218ENST00000629219 162 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 IPO11-201ENST00000325324 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 WDR92-202ENST00000406245 1401 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 DSC3-202ENST00000434452 6978 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CACNB1Q02641 PDE4D-208ENST00000502484 2478 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms