Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
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PTPRMP28827 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
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PTPRMP28827 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
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PTPRMP28827 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
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PTPRMP28827 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
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PTPRMP28827 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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PTPRMP28827 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRMP28827 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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