Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 TRMT2B-AS1-201ENST00000443801 205 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 VDAC3-206ENST00000521158 949 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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LINC00587B1AMM8 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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LINC00587B1AMM8 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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