Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAMTA1Q9Y6Y1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAMTA1Q9Y6Y1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms