Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX8Q9Y5X2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX8Q9Y5X2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms