Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX10Q9Y5X0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX10Q9Y5X0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX10Q9Y5X0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX10Q9Y5X0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX10Q9Y5X0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX10Q9Y5X0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX10Q9Y5X0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX10Q9Y5X0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX10Q9Y5X0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX10Q9Y5X0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX10Q9Y5X0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX10Q9Y5X0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms