Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PAXBP1Q9Y5B6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms