Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL11Q9Y3B7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL11Q9Y3B7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms