Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRAP3Q9Y2W1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
THRAP3Q9Y2W1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms