Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK2Q9UPX8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms