Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALKQ9UM73 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms