Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NRXN1Q9ULB1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRXN1Q9ULB1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms