Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC9Q9UKV0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC9Q9UKV0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms