Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA4Q9UI42 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA4Q9UI42 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms