Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCF2Q9UG63 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms