Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHPF2Q9P2E5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHPF2Q9P2E5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms