Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CALCOCO1Q9P1Z2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CALCOCO1Q9P1Z2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CALCOCO1Q9P1Z2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CALCOCO1Q9P1Z2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CALCOCO1Q9P1Z2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALCOCO1Q9P1Z2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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