Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CABP1Q9NZU7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABP1Q9NZU7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms