Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TVP23BQ9NYZ1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms