Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD3Q9NYL9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD3Q9NYL9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
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