Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MS4A12Q9NXJ0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A12Q9NXJ0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms