Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB4Q9NTQ9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB4Q9NTQ9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms