Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PKDREJQ9NTG1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKDREJQ9NTG1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms