Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNNM1Q9NRU3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNNM1Q9NRU3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms