Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms