Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W1

MS4A6A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6AQ9H2W1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
MS4A6AQ9H2W1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms