Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSER1Q9C0I3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSER1Q9C0I3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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