Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms