Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHANK3Q9BYB0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms