Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC12A9Q9BXP2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC12A9Q9BXP2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms